Před provozem zahušťovače se musí obsluha seznámit s konstrukcí zařízení a provozními postupy a provést komplexní kontrolu. Vstup krmení, vypouštěcí výstup a přepadový žlab musí být udržovány volné a volné; kritické součásti-jako je míchací hřídel, hrábě, ložiska a motor-musí být ve správném provozním stavu. Před spuštěním je nutné vyčistit veškerý zbytkový materiál v nádrži a ověřit správnou funkci mazacího systému a těsnicích mechanismů, aby se zabránilo mechanickému poškození nebo netěsnostem při aktivaci. Operátoři jsou povinni nosit nezbytné osobní ochranné prostředky k ochraně před náhodným zraněním.
Během provozu zahušťovače je třeba věnovat pečlivou pozornost řízení rychlosti posuvu a hladiny kapaliny; tím se zabrání přetížení materiálu nebo nadměrné hladině kapaliny, což by mohlo vést k flotaci kalu nebo nerovnoměrnému promíchání. Hrábě a míchací systém musí být udržovány na odpovídající rychlosti otáčení, aby se zabránilo zadření hrábí nebo přetížení ložisek. U materiálů vyznačujících se vysokou koncentrací, vysokou viskozitou nebo přítomností jemných částic je třeba používat flokulanty uvážlivě-nebo upravit průtok tekutiny-, aby se zvýšila rychlost usazování a zvýšila se koncentrace vypouštěných pevných látek. Současně by měly být prováděny pravidelné kontroly pro sledování vibrací zařízení, hladiny hluku a kolísání proudu motoru; jakékoli anomálie musí být okamžitě vyřešeny, aby byl zajištěn bezpečný a stabilní provoz zařízení.
Bezpečnostní opatření zůstávají stejně důležitá během fází odstávky a údržby. Před odstavením je třeba nejprve snížit rychlost posuvu; napájení by mělo být odpojeno až poté, co se zařízení přirozeně zastaví, a je třeba ověřit, že se shrnovače a oběžná kola zcela zastavily. Při čištění nádrže, oběžných kol a hrábí je třeba dbát na to, aby nedošlo k mechanickému nárazu nebo poškození; současně by měla být zkontrolována ložiska, těsnění a mazací systém, aby se zjistilo, zda je nutná údržba nebo výměna. Dodržováním standardizovaných provozních postupů a prováděním včasné údržby mohou operátoři nejen prodloužit životnost zahušťovadla, ale také zajistit konzistentní účinnost separace pevných-kapalin a současně minimalizovat výrobní nehody a snížit provozní náklady.

